قد يكتشف البعض وجود بقعة متعفنة على الفاكهة قبل تناولها، ما يثير التساؤل بشأن إمكانية إزالة الجزء المصاب والاكتفاء بتناول بقية الثمرة. ويعتمد ذلك على نوع الفاكهة ومدى صلابتها واحتوائها على الرطوبة.
وفي حال الفواكه الصلبة، مثل التفاح وبعض أنواع الكمثرى، يمكن عادةً قطع الجزء المتعفن مع إزالة مساحة لا تقل عن 2.5 سنتيمتر حوله، ثم تناول الجزء السليم. وينصح بعدم تمرير السكين مباشرة عبر العفن لتجنب انتقاله إلى أجزاء أخرى من الثمرة.
أما الفواكه الطرية، مثل الخوخ والتوت والبرتقال، فمن الأفضل التخلص منها بالكامل عند ظهور العفن عليها؛ لأن الفطريات قد تكون انتشرت داخل الثمرة دون أن تكون مرئية. وإذا ظهر العفن على ثمرة أو اثنتين من التوت، فيمكن التخلص من الثمار المصابة وأي ثمار لامستها مباشرة، بدلًا من التخلص من الكمية كلها. العفن نوع من الفطريات ينتج أبواغًا يمكن أن تنتقل إلى الأطعمة المجاورة. وتساعد الرطوبة المرتفعة، الموجودة خصوصًا في الفواكه الطرية، على نموه وانتشاره إلى ما يتجاوز الجزء الظاهر. ورغم أن معظم أنواع العفن غير ضارة، فإن بعضها قد يسبب الحساسية أو مشكلات في التنفس، كما يمكن لبعض الأنواع إنتاج السموم الفطرية التي قد تسبب المرض.